MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 38487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	307126152
2	NC_014498	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	307126152
3	NC_014498	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126152
4	NC_014498	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307126152
5	NC_014498	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126152
6	NC_014498	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
7	NC_014498	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126152
8	NC_014498	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126152
9	NC_014498	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	307126152
10	NC_014498	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126152
11	NC_014498	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
12	NC_014498	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	307126152
13	NC_014498	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
14	NC_014498	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	307126152
15	NC_014498	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126152
16	NC_014498	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126152
17	NC_014498	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
18	NC_014498	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126152
19	NC_014498	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126152
20	NC_014498	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	307126152
21	NC_014498	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126152
22	NC_014498	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126152
23	NC_014498	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	307126152
24	NC_014498	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	307126152
25	NC_014498	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	307126152
26	NC_014498	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	307126152
27	NC_014498	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	307126152
28	NC_014498	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126152
29	NC_014498	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126153
30	NC_014498	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	307126153
31	NC_014498	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126153
32	NC_014498	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	307126153
33	NC_014498	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
34	NC_014498	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
35	NC_014498	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
36	NC_014498	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126153
37	NC_014498	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
38	NC_014498	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	307126153
39	NC_014498	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126153
40	NC_014498	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126153
41	NC_014498	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	307126153
42	NC_014498	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
43	NC_014498	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	307126153
44	NC_014498	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
45	NC_014498	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126153
46	NC_014498	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126153
47	NC_014498	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126153
48	NC_014498	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	307126153
49	NC_014498	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126153
50	NC_014498	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	307126153
51	NC_014498	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	307126153
52	NC_014498	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126153
53	NC_014498	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126154
54	NC_014498	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	307126154
55	NC_014498	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	307126154
56	NC_014498	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126154
57	NC_014498	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126154
58	NC_014498	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126154
59	NC_014498	GTA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126155
60	NC_014498	TAAATC	2	12	3568	3579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307126155
61	NC_014498	ATCT	2	8	3640	3647	25 %	50 %	0 %	25 %	307126155
62	NC_014498	ATCA	2	8	3676	3683	50 %	25 %	0 %	25 %	307126155
63	NC_014498	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	307126155
64	NC_014498	TGG	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126156
65	NC_014498	GGT	2	6	3824	3829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126156
66	NC_014498	TAG	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126156
67	NC_014498	TTTC	2	8	3876	3883	0 %	75 %	0 %	25 %	307126156
68	NC_014498	AAT	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126156
69	NC_014498	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126156
70	NC_014498	CT	3	6	4104	4109	0 %	50 %	0 %	50 %	307126156
71	NC_014498	TCA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126156
72	NC_014498	CTT	2	6	5380	5385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126157
73	NC_014498	AT	3	6	5447	5452	50 %	50 %	0 %	0 %	307126157
74	NC_014498	CCA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
75	NC_014498	CTT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126157
76	NC_014498	AAATAC	2	12	5585	5596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307126157
77	NC_014498	AAAG	2	8	5637	5644	75 %	0 %	25 %	0 %	307126157
78	NC_014498	ACC	2	6	5656	5661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
79	NC_014498	CCA	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126157
80	NC_014498	AATC	2	8	5706	5713	50 %	25 %	0 %	25 %	307126157
81	NC_014498	AATC	2	8	5727	5734	50 %	25 %	0 %	25 %	307126157
82	NC_014498	ATT	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126157
83	NC_014498	AAT	2	6	5906	5911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126158
84	NC_014498	AAGC	2	8	6033	6040	50 %	0 %	25 %	25 %	307126158
85	NC_014498	TTC	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126158
86	NC_014498	TAGTT	2	10	6220	6229	20 %	60 %	20 %	0 %	307126158
87	NC_014498	TCC	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126158
88	NC_014498	CTA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126158
89	NC_014498	AT	3	6	6313	6318	50 %	50 %	0 %	0 %	307126158
90	NC_014498	CCA	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126158
91	NC_014498	TGT	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126158
92	NC_014498	TC	3	6	6958	6963	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
93	NC_014498	TTA	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126159
94	NC_014498	TGT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126159
95	NC_014498	AGT	2	6	7209	7214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126159
96	NC_014498	TTC	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126159
97	NC_014498	TTC	2	6	7231	7236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126159
98	NC_014498	GT	3	6	7270	7275	0 %	50 %	50 %	0 %	307126159
99	NC_014498	TTGA	2	8	7285	7292	25 %	50 %	25 %	0 %	307126159
100	NC_014498	TCA	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126159
101	NC_014498	TTG	2	6	7427	7432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126159
102	NC_014498	CCA	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126159
103	NC_014498	TACC	2	8	7605	7612	25 %	25 %	0 %	50 %	307126159
104	NC_014498	AT	3	6	7662	7667	50 %	50 %	0 %	0 %	307126159
105	NC_014498	GTT	2	6	7717	7722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126159
106	NC_014498	AGA	2	6	7734	7739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126159
107	NC_014498	ATC	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126159
108	NC_014498	CT	3	6	7861	7866	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
109	NC_014498	CTTG	2	8	7909	7916	0 %	50 %	25 %	25 %	307126159
110	NC_014498	CT	3	6	8059	8064	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
111	NC_014498	TTC	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126159
112	NC_014498	AGG	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126159
113	NC_014498	CT	3	6	8377	8382	0 %	50 %	0 %	50 %	307126159
114	NC_014498	CT	3	6	8440	8445	0 %	50 %	0 %	50 %	307126160
115	NC_014498	TAC	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126160
116	NC_014498	CCT	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126160
117	NC_014498	TGT	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126160
118	NC_014498	TAC	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126160
119	NC_014498	TCA	2	6	8908	8913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126160
120	NC_014498	GTT	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126160
121	NC_014498	CAC	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307126160
122	NC_014498	CTATG	2	10	8953	8962	20 %	40 %	20 %	20 %	307126160
123	NC_014498	AAATC	2	10	9064	9073	60 %	20 %	0 %	20 %	307126160
124	NC_014498	GTT	2	6	9092	9097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126160
125	NC_014498	TCC	2	6	9171	9176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126160
126	NC_014498	TCAT	2	8	9292	9299	25 %	50 %	0 %	25 %	307126160
127	NC_014498	CGG	2	6	9361	9366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307126161
128	NC_014498	TATT	2	8	9447	9454	25 %	75 %	0 %	0 %	307126161
129	NC_014498	CCT	2	6	9574	9579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126162
130	NC_014498	TCA	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126162
131	NC_014498	CTC	2	6	9638	9643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126162
132	NC_014498	CGC	2	6	9721	9726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307126162
133	NC_014498	TGT	2	6	9748	9753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126162
134	NC_014498	ACT	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126162
135	NC_014498	TTCT	2	8	9790	9797	0 %	75 %	0 %	25 %	307126162
136	NC_014498	TCC	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126163
137	NC_014498	TTTA	2	8	9921	9928	25 %	75 %	0 %	0 %	307126163
138	NC_014498	CGCT	2	8	9944	9951	0 %	25 %	25 %	50 %	307126163
139	NC_014498	TTG	2	6	10070	10075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126163
140	NC_014498	T	6	6	10133	10138	0 %	100 %	0 %	0 %	307126163
141	NC_014498	ATTC	2	8	10167	10174	25 %	50 %	0 %	25 %	307126163
142	NC_014498	TCCC	2	8	10177	10184	0 %	25 %	0 %	75 %	307126164
143	NC_014498	AT	3	6	10209	10214	50 %	50 %	0 %	0 %	307126164
144	NC_014498	T	7	7	10288	10294	0 %	100 %	0 %	0 %	307126164
145	NC_014498	GGT	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126164
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149	NC_014498	TCAT	2	8	10377	10384	25 %	50 %	0 %	25 %	307126164
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155	NC_014498	AATC	2	8	10600	10607	50 %	25 %	0 %	25 %	307126166
156	NC_014498	TA	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	307126166
157	NC_014498	T	6	6	10659	10664	0 %	100 %	0 %	0 %	307126166
158	NC_014498	T	6	6	10670	10675	0 %	100 %	0 %	0 %	307126166
159	NC_014498	CATA	2	8	10704	10711	50 %	25 %	0 %	25 %	307126166
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167	NC_014498	ACT	2	6	10890	10895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126166
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169	NC_014498	TGT	2	6	10935	10940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126166
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171	NC_014498	CTG	2	6	10998	11003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126166
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173	NC_014498	TTG	2	6	11065	11070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126166
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252	NC_014498	CAA	2	6	16995	17000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126176
253	NC_014498	GAA	2	6	17031	17036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126176
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255	NC_014498	TGG	2	6	17159	17164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126176
256	NC_014498	GCT	2	6	17247	17252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126176
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261	NC_014498	AGAA	2	8	17440	17447	75 %	0 %	25 %	0 %	307126176
262	NC_014498	GAT	2	6	17460	17465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126176
263	NC_014498	TGA	2	6	17486	17491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126176
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265	NC_014498	GAC	2	6	17758	17763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126177
266	NC_014498	AG	3	6	17781	17786	50 %	0 %	50 %	0 %	307126177
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271	NC_014498	TCAA	2	8	18027	18034	50 %	25 %	0 %	25 %	307126177
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279	NC_014498	A	6	6	18364	18369	100 %	0 %	0 %	0 %	307126177
280	NC_014498	TAAA	2	8	18384	18391	75 %	25 %	0 %	0 %	307126177
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283	NC_014498	A	6	6	18828	18833	100 %	0 %	0 %	0 %	307126177
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381	NC_014498	AAACG	2	10	23693	23702	60 %	0 %	20 %	20 %	307126180
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389	NC_014498	AAGA	2	8	24125	24132	75 %	0 %	25 %	0 %	307126180
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391	NC_014498	GAA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126180
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